«Универ. 13 лет спустя» показывает, как сложилась жизнь знакомых героев после студенчества. Антон, наконец-то свободный, владеет собственным пабом и кажется, что он добился идеального баланса между работой и удовольствиями. Но эта картина резко меняется, когда на пороге его заведения появляется взрослая дочь, о которой он не знал. Её появление выбивает почву из-под ног и заставляет задуматься, тем ли он жил все эти годы. Параллельно мы видим другие истории. Майкл, несмотря на боль от прошлого, пытается заново построить отношения с Варей, хотя их развод был вызван её предательством. А Маша полностью погружена в заботы о детях, пока её муж Валя увлечён важным научным исследованием. Её будни однообразны и предсказуемы, пока в них не врывается призрак из прошлого. Этим призраком оказывается Кузя, бывший парень Маши, который превратился в преуспевающего делового человека. Он приезжает в Москву якобы для развития бизнеса, но на самом деле его главная цель — вернуть ту, которую он когда-то потерял. Его возвращение ставит под вопрос всё, во что верила Маша, и грозит перевернуть размеренную жизнь всех героев, заставив их снова делать непростой выбор между прошлым и настоящим.